凌云站位于宗澤北路和洪深路交叉口南側，車站沿宗澤北路中綠化帶呈近東西向布置，車站總建筑面積為8986.37㎡，是一座高架三層側式車站，共設A1、A2、B1、B2四個出入口。凌云站毗鄰義烏高鐵站，日常除通勤客流外，更多為往返高鐵站的接駁客流，客流流向明顯。為方便遠行乘客，車站聯同恒風公交集團建立凌云-義烏火車站公交專線。